Plan du cours

Introduction au langage de programmation Python

  • Pourquoi Python ?
  • Utiliser Python pour traiter des données biologiques
  • Travailler avec l'interpréteur de commandes iPython
  • Votre premier programme
  • Écrire des scripts Python
  • Importer des modules

Travailler avec des séquences de protéines et d'ARN/ADN

  • Trouver des motifs
  • Transcription et traduction in silico
  • Traitement des alignements de séquences

Analyse des données dans différents formats biologiques

  • Analyse de FASTA
  • Conversions de formats de données

Exécution d'analyses biologiques

  • BLAST
  • [Services web biologiques

Traitement des structures biologiques en 3D à l'aide de Python

Python facilite l'analyse statistique

Visualisation des données

  • Création de diagrammes à barres et de diagrammes de dispersion
  • Calculer l'aire sous la courbe (AUC)

Travailler avec des fichiers .xls et .csv

  • Importer des données depuis et exporter vers MS Excel / OpenOffice Calc
  • Rédaction de fichiers .xls et .csv

Utilisation de Python pour créer un pipeline de traitement de données automatisé

Pré requis

Connaissances biologiques de base sur les séquences de protéines, d'ARN et d'ADN.

  28 heures

Nombre de participants


Début

Fin


Dates are subject to availability and take place between 09:30 and 16:30.

Prix par participant

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