Formation Fiji : Traitement d'images pour la biotechnologie et la toxicologie

Introduction à Fiji et ImageJ

• Aperçu de Fiji et de ses applications en recherche scientifique
• Compréhension de l'architecture d'ImageJ et de ses plug-ins
• Installation et configuration de Fiji pour des performances optimales

Techniques de base de traitement d'images

• Acquisition d'images et formats d'importation
• Ajustement du contraste, de la luminosité et application de filtres
• Piègement d'images et méthodes de projection

Analyse d'images avancée

• Techniques de segmentation : seuillage et détection de contours
• Comptage d'objets et analyse de particules dans les échantillons histologiques
• Mesure des surfaces, des périmètres et d'autres caractéristiques morphologiques

Travail avec des échantillons biologiques

• Traitement d'images de tissus histologiques, de globules et d'algues
• Déconvolution de couleurs et analyse de tissus colorés
• Analyse en séquences temporelles et suivi du mouvement cellulaire

Automatisation et personnalisation

• Création et exécution de macros pour les tâches répétitives
• Utilisation de plug-ins Fiji pour des analyses spécialisées
• Scripting de base avec ImageJ Macro Language (IJM)

Gestion des données et rapports

• Exportation des résultats et génération de rapports
• Annotation des images et préparation des données pour publication
• Meilleures pratiques pour une analyse d'images reproductible