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Plan du cours
Introduction à Fiji et ImageJ
- Aperçu de Fiji et ses applications dans la recherche scientifique
- Comprendre l'architecture d'ImageJ et ses plugins
- Installation et configuration optimale de Fiji
Techniques de Traitement d’Images de Base
- Acquisition et formats d'importation d'images
- Ajustement du contraste, de la luminosité et application de filtres
- Empilement et méthodes de projection d’images
Techniques Avancées Image Analysis
- Techniques de segmentation : seuillage et détection de contours
- Comptage d'objets et analyse des particules dans les échantillons histologiques
- Mesure des surfaces, des périmètres et d'autres caractéristiques morphologiques
Travail avec des Échantillons Histologiques Bio
- Traitement d’images de tissus histologiques, de globules sanguins et d'algues
- Déconvolution chromatique et analyse des tissus teintés
- Analyse du laps de temps et suivi du mouvement cellulaire
Automatisation et Personnalisation
- Création et exécution de macros pour des tâches répétitives
- Utilisation de plugins Fiji pour analyses spécialisées
- Scripting de base avec le langage ImageJ Macro (IJM)
Rapports et Présentation des Résultats
- Exportation des résultats et génération de rapports
- Annotation d'images et préparation des données pour la publication
- Meilleures pratiques pour une analyse d’image reproductible
Résumé et Étapes Suivantes
Pré requis
- Compréhension de base des concepts d'imagerie biologique
- Familiarité avec la microscopie et les techniques histologiques
- Littératie informatique de base
Public cible
- Chercheurs en biotechnologie et toxicologie environnementale
- Techniciens de laboratoire travaillant avec l'imagerie histologique et cellulaire
- Scientifiques intéressés par l'analyse quantitative d'images
14 Heures
