Formation Image Analysis en Lyon

Cette formation dirigée par un instructeur (en ligne ou sur site) est destinée aux chercheurs et professionnels de laboratoire débutants à intermédiaires qui souhaitent traiter et analyser des images liées aux tissus histologiques, aux cellules sanguines, aux algues et autres échantillons biologiques.

À la fin de cette formation, les participants seront en mesure de :

• Naviguer dans l'interface de Fiji et utiliser les fonctions de base d'ImageJ.
• Prétraiter et améliorer les images scientifiques pour une meilleure analyse.
• Analyser les images quantitativement, y compris le comptage de cellules et la mesure d'aires.
• Automatiser les tâches répétitives à l'aide de macros et de plugins.
• Personnaliser des flux de travail pour répondre aux besoins spécifiques d'analyse d'images en recherche biologique.

Fiji est un puissant package de traitement d'images open-source qui intègre ImageJ (un programme conçu pour les images scientifiques multidimensionnelles) ainsi qu'une suite complète de plugins pour l'analyse d'images scientifiques.

Lors de cette formation en présentiel animée par un instructeur, les participants apprendront à exploiter la distribution Fiji et le programme ImageJ sous-jacent pour créer des applications d'analyse d'images robustes.

À l'issue de cette formation, les participants seront capables de :

• Utiliser les fonctionnalités de programmation avancées et les composants logiciels de Fiji pour étendre les capacités d'ImageJ
• Assembler de grandes images 3D à partir de tuiles se recoupant
• Automatiser la mise à jour d'une installation de Fiji au démarrage en utilisant le système intégré de mise à jour
• Choisir parmi une large palette de langages de script pour créer des solutions d'analyse d'images personnalisées
• Utiliser les puissantes bibliothèques de Fiji, telles que ImgLib, pour traiter efficacement de grands jeux de données bioimage
• Déployer des applications et collaborer efficacement avec d'autres scientifiques sur des projets similaires

Format de la formation

• Conférence interactive et discussions
• Exercices approfondis et applications pratiques
• Mise en œuvre concrète dans un environnement de laboratoire en direct

Options de personnalisation du cours

• Pour demander une formation personnalisée pour ce cours, veuillez nous contacter pour organiser cela.